Meetod, mis suudab tuvastada vähi põhjuseid, mis on geneetilisele järjestusele nähtamatud, on avastanud suure hulga varem tundmatuid kõhunäärmevähi geene. Loodetakse, et see uuring hoogustab uuringuid haiguse kohta, mida siiani halvasti mõistetakse ja mille viieaastase elulemuse määr on viimase nelja aastakümne jooksul olnud umbes 5%.
Meetod toimib, viies hiire genoomi DNA lõigud, mida nimetatakse piggyBac-transposoonideks. Transposoonid hüppavad genoomis ringi, sisestades end juhuslikult ja põhjustades hiire igas rakus erineva mutatsiooni. See käivitab vähi arengu ja transposooni sõrmejälgede jälgimine kasvajates võimaldab avastada mõjutatud vähki põhjustavaid geene. PiggyBaci tööriist töötati esmakordselt välja nii, et see võimaldaks vähki esile kutsuda hiire üksikutes kudedes ja seda meetodit saab nüüd kasutada mis tahes tüüpi vähi uurimiseks.
Kuigi genoomi järjestamisega saab suure täpsusega tuvastada kõiki geneetiliste muutuste kategooriaid, on mõnda neist muutustest raske tõlgendada. Näiteks leitakse, et sadu või tuhandeid geene on vähis transkriptsiooniliselt või epigeneetiliselt reguleerimata, mis tähendab, et need ei ole muteerunud, vaid lihts alt lülitatakse sisse või välja. Nende suurte geenikomplektide hulgas on väheste vähki põhjustavate sündmuste kindlaksmääramine äärmiselt keeruline. PiggyBaci sõelumine võib hõlbustada nõela otsimist heinakuhjas, kuna transposoonid hüppavad otse asjakohastesse geenidesse. Lisaks jälgib tööriist kasvajate arengut hiirtel ja seetõttu saavad teadlased näha ka vähimutatsioonide tagajärgi ja seda, kuidas need aitavad haigusel edasi areneda.
"Hiljutised edusammud vähi genoomi järjestamisel on andnud erakordse ülevaate vähi aluseks olevatest geneetilistest sündmustest. Sellegipoolest pole me veel kaugel vähi arengut juhtivate molekulaarsete protsesside keerukuse mõistmisest," ütleb professor Roland Rad Technischest. Universität München ja Saksamaa Vähiuuringute Keskus. "Hiirte erapooletu genoomi hõlmav sõeluuring võimaldab meil näha vähki erineva nurga alt ja vastata bioloogilistele küsimustele, mida ei saa lahendada muude lähenemisviisidega."
Uuringus tuvastati palju geene, mis varem teadmata oleksid seotud kõhunäärmevähiga, sealhulgas Foxp1, mida tabasid transposoonid väga kõrgel sagedusel 49 uuritud hiire kasvajas. Kui Foxp1 indutseeriti, levisid kasvajad kõhunäärmest teistesse organitesse, mis viitab sellele, et geen põhjustab vähi progresseerumist. See leid leidis kinnitust, kui teadlased vaatlesid inimese proove ja leidsid metastaseerunud vähkkasvajate puhul geeniprodukti FOXP1 kõrge taseme.
Paljudel hiirtel olid transposoonid sisestatud genoomi mittekodeerivatesse piirkondadesse. Need sisestused määrasid kindlaks võimendajapiirkonnad, mis on seotud vähki põhjustavate geenide reguleerimisega. Lisaks tekkisid hiirtel sarnaselt inimestega erinevad kõhunäärmevähi alatüübid, millel ei ole mitte ainult iseloomulik mikroskoopiline välimus, vaid ka erinev kliiniline käitumine. Uuring avastas nende vähi alatüüpide moodustumise käivitamise eest vastutavad molekulaarsed protsessid.
Teadlased saavad nüüd põhjalikum alt uurida selle uuringuga avastatud kõhunäärmevähi geene, lootuses leida tõhusaid ravimeid haiguse jaoks, mis on 2030. aastaks vähisurmade teine põhjus. Laboratooriumid on hakanud seda tehnikat kasutama ka vähkkasvajate uurimiseks teistes kudedes.
